Флаг Богучанского района разработан на основе герба Богучанского района и повторяет его многозначную символику. Богучанский район расположен на северо-востоке Красноярского края вдоль реки Ангара. Богучанский район - один из наиболее богатых природными ресурсами территорий Красноярского края. Здесь есть реки, многочисленные леса, месторождения природного газа, железных руд, цветных и редких металлов, угля, нерудных полезных ископаемых. По условия проживания район приравнен к районам Крайнего Севера. В 1933 году открывается первый в районе леспромхоз и начинается развитие лесной промышленности, которая до настоящего времени является социально-экономической базой района. Богучанский район обладает весьма развитой промышленностью: Богучанский алюминиевый завод, Богучанский газоперерабатывающий завод, целлюлозно-бумажный комбинат и другие предприятия. Символика флага Богучанского района отражает его географию, природные богатства, прошлое и настоящее и потому многозначна: - соболь - не только традиционный символ Сибири, но издавна неофициально был в местной символике. К тому же, первоначально малоблагоприятные для земледелия, природно-климатические условия определяли местное население к пушному промыслу и рыболовству. Соболь символизирует богатую фауну Богучанского района, как кладезь природных сокровищ. - сосновая ветка в лапах соболя символизирует леса Богучанского района - практически вся территория покрыта хвойными лесами, среди которых особую ценность представляет знаменитая ангарская сосна - аллегория лесной промышленности района; - серебряные ступени - аллегория условий проживания Богучанского района, приравненного к районам Крайнего Севера; - соболь, поднимающийся по серебряным ступеням - символ развития, восхождения, обновления, преодоления суровых природных условий, аллегорически показывает устремленность Богучанского района в будущее; - лазоревая перевязь с волнами, напоминающими речные буруны - символ своенравной реки Ангары, с именем которой связано много местных легенд. Зеленый цвет - символ природы, экологии, молодости, обновления, надежды и здоровья. Синий цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения. Желтый цвет (золото)- символ высшей ценности жизни, величия, богатства, урожая, стабильности. | 
