Флаг разработан на основе герба городского поселения Томилино. Флаг городского поселения языком геральдических символов гармонично отражает историю зарождения административного центра поселения поселка Томилино, природные особенности его расположения, а так же основной профиль деятельности местного населения. Желтое стропило с орнаментом указывает на то, что основание поселка связано со строительством деревянных дач, для которых резные стропила были характерным украшением фасадов. Белые ромбы-звезды, пропеллеры и голубой цвет символизируют основную сферу деятельности местных предприятий, связанных с авиацией и космонавтикой. Петух с ромбом-алмазом в клюве показывает другие производства, действующие в поселке: первую в стране промышленную птицефабрику и завод алмазного инструмента. Голубой цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения. Зеленое поле отражает расположение поселения в зеленом поясе, окружающем Москву. Зеленый цвет символизирует весну, здоровье, природу, молодость и надежду. Желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения. Красный цвет (червлень) - символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника. | 
