Флаг Машуковского сельсовета составлен на основе герба Машуковского сельсовета и повторяет его символику. Муниципальное образование Машуковский сельсовет Мотыгинского муниципального района с богатой природой, рекой, природными ресурсами в недрах земли - основа современного и будущего её территории и по праву считается жемчужиной Мотыгинского муниципального района Красноярского края, расположенной в самом центре Сибири в нижнем течении реки Ангара, на реке Тасеева. Наиболее древним селом в поселении значится деревня Михалево, основанное в 1654 году, в 1690 году образовалась деревня Устье, где принимали с дальнейшей отправкой соль с Троицкого соляного завода. Поселок Машуковка значится с 1768 года, но основное развитие получил в 1935 году, куда были поселены ссыльные с Читинской области, на заготовку древесины. Зеленое поле герба символизирует лесные богатства муниципального образования. Запасы хвойной древесины и дикоросов (ягоды, грибы, кедровый орех), птицы и дичи - основной возобновляемый ресурс и основа экономики. Освоение территории шло вдоль реки Тасеевой, которая была основной транспортной артерией для молевого сплава леса, поэтому все населенные пункты построены на берегах реки Тасеева, в гербе на это указывает лазоревая оконечность. Водные ресурсы реки Тасеева - это и транспортные магистрали, обеспечивающие пассажирские перевозки и транспортировку грузов, и богатые рыбой водоемы, и источник лечебных вод. Глухарь - символ мудрости, осторожности, процветания и благополучия, который хранит здоровье человека и отпугивает от него злых духов. Топор и осетр символически указывают на основной вид деятельности местных жителей - заготовку древесины, и рыболовство. Динамичная композиция стоящего глухаря на топоре - аллегория сплава древесины по реке, где белое (серебряное) лезвие топора выступает как парус. Осетр по праву считается главной добычей жителей в богатой всеми видами рыб в реке Тасеева. Примененные во флаге цвета и металлы дополняют его символику: синий цвет (лазурь) - символ обширных водных пространств территории, его реки с притоками и озер, также, символ чести, истины, возвышенных устремлений, возрождения; зеленый цвет - символ плодородия, весны, надежды и здоровья; желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, великодушия, богатства, урожая; белый цвет (серебро) - символ простоты, совершенства, мудрости, благородства, мира и взаимного сотрудничества. | 
