Флаг создан с учетом герба Мценского района, который разработан на основе исторического герба города Мценска Орловского наместничества, Высочайше утвержденного 16 августа 1781 года (по старому стилю). Подлинное описание исторического герба гласит: "Въ верхней части щита гербъ Орловскiй. Въ нижней пшеничные четыре снопа, въ знакъ благословеннаго сей страны изобилiя хл?бовъ". Использование в качестве геральдической основы исторического герба символизирует бережное отношение жителей района к своему прошлому, тесную историческую связь города и района. Символика креста на флаге района многозначна: - Крест - это перепутье дорог - на территории района издавна встречались дороги разных направлений и это причина того, что в XVII столетии Мценск стал крупным хлеботорговым центром. Об этом говорят хлебные снопы, лежащие на лапах креста. - Снопы и крест символизируют земледелие как основу экономики района. - На территории современного района найдены многочисленные городища одного из восточнославянских племен - вятичей. Крест напоминает о легенде о монахе Кукше сподвижнике Черниговского архипастыря Феоктиста и первокрестителе вятичей. Желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважении и интеллекте. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания. Зеленый цвет - символ молодости, здоровья, природы, жизненного роста. | 
