Флаг Рыбинского муниципального округа составлен на основании герба Рыбинского муниципального округа и повторяет его символику, который, языком знаков и символов отражает исторические, природно-географические и экономические особенности округа. Рыбинский муниципальный округ был образован в 2025 году, объединением двух муниципальных образований: Рыбинского муниципального района и городского округа города Бородино. Флаг, как и герб Рыбинского муниципального округа создан на основе гербов: Рыбинского муниципального района (1-ая и 4-ая четверти герба) и городского округа города Бородино. (2-ая и 3-ья четверти), соблюдая геральдическое равенство прежних владельцев гербов. Символика герба и флага единого муниципального образования – Рыбинского муниципального округа включает символику прежних гербов и потому многозначна. 1-я и 4-я части полотнища повторяют фигуры из герба Рыбинского муниципального района. Освоение Рыбинской земли началось в XVII столетии. Активному заселению земель способствовало постройка в XVIII веке Сибирско-московского тракта. При строительстве ямщицких станций, было основано и поселение Рыбинское на реке Рыбной. В геральдике особым уважением пользуются говорящие фигуры, которые указывают на имя владельца. Во флаге Рыбинского муниципального округа (ранее – района) название отражено основной фигурой: серебряной рыбой – щукой. Синим (лазоревым) цветом подчёркивается особая роль водных ресурсов в жизни населения Рыбинского муниципального округа, которая видна даже по названиям населённых пунктов – Рыбное, Большие Ключи, Заозёрный. Три геральдические городские короны, сквозь которые продета щука, символизируют три города, находящихся в границах Рыбинского муниципального округа: Зеленогорск, Бородино и Заозёрный (в отечественной геральдике золотая башенная корона, венчая щит, указывает на статус города). Щука в геральдике – символ силы, уверенности, скорости. 2-я и 3-я части полотнища повторяют фигуры из герба города Бородино, языком символов и аллегорий отражая его исторические и экономические особенности. Еще в 30-е годы XIX столетия около села Бородино были обнаружены месторождения бурого угля. В конце века был проведен целый ряд горно-геологических работ, в результате которых был выявлен основной угольный пласт «Бородинский». Капитальная разведка и начало разработок угля началось спустя почти столетие – в 30-х годах ХХ века. Своим возникновением и развитием посёлок, а затем город Бородино обязан форсированному развитию Канско-Ачинского топливно-энергетического комплекса (КАТЭК). Начало разработок ускорила Великая Отечественная война, когда из-за потери угольной промышленности западных регионов потребовалось восполнить недостаток топлива. В начале восьмидесятых годов ХХ столетия Ирша-Бородинский разрез стал крупнейшим угольным предприятием страны. Желтый (золотой) красноярский лев, возникающий из горы угля, символизирует огромную роль Бородинского угледобывающего комплекса, для обеспечения энергетики края и всей страны. Гора чёрного угля в основании 2-й и 3-й частей полотнища – это фундамент, на котором основано процветание города. Примененные в гербе Рыбинского муниципального округа цвета и металлы дополняют значение символики: – желтый цвет (золото) символизирует прочность, стабильность, богатство, уважение, интеллект, великодушие; – белый цвет (серебро) – символ чистоты, благородства, мира, сотрудничества; – синий (лазоревый) цвет – символ красоты, безупречности, возвышенных устремлений, добродетели; – красный (червленый) цвет – символ тепла, силы, мужества, труда и красоты, усиливает символику герба, подчеркивая молодость и красоту города, направленность его развития в будущее; – чёрный цвет – символ мудрости, скромности, вечности бытия. Таким образом, флаг, как и герб языком знаков и символов отражает исторические, природно-географические и экономические особенности Рыбинского муниципального округа. | 
