Флаг сельского поселения «Том» создан на основе герба сельского поселения «Том» и повторяет его многозначную трактовку символики: – глухари – символ лесной фауны, яркие её представители; – по одной из версий в названии поселка Койю правильнее было бы «Койтью» (токовище глухарей); – во флаге совместно с пилой являются аллегорией лесорубов; – двуручная пила – традиционный для геральдики образ; – во флаге сельского поселения «Том» пила служит символом труда и мужества первых поселенцев поселков Том и Койю, наладивших в суровых северных условиях промышленную лесозаготовку; – работа пилой требует слаженности и взаимного понимания для эффективного вала леса; – состав сельского поселения «Том» аллегорически отражен тремя фигурами: двумя тетеревами и пилой. Деревня Картаёль основана в период между 1763 и 1768 годами выходцами из Ижемской слободки (ныне — село Ижма). Зеленый цвета полосы вдоль древка флага сельского поселения «Том» перекликается с цветом герба и флага муниципального района «Ижемский», а желтая (золотая) полоса, выложенная из десяти элементов национального узора, указывает на количество сельских поселений, составляющих муниципальный район «Ижемский». В тоже время, неровные края желтой полосы аллегорически символизируют расположение всех населенных пунктов муниципального района «Ижемский» на берегах рек Печоры и Ижмы. Выложенная из элементов национального узора, полоса подчеркивает самобытность коренного местного населения, его этнос. Такие две полосы, с десятью элементами национального узора, символизирует принадлежность сельского поселения «Том» к муниципальному району «Ижемский» и изображена во флагах всех сельских поселений муниципального района «Ижемский», тем самым создавая их геральдическое единство. Примененные во флаге цвета и металлы дополняют его символику: – синий цвет (лазурь)– символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения; – зеленый цвет символизирует природу, весну, здоровье, молодость и надежду; – желтый цвет (золото) – символ высшей ценности, богатства, величия, постоянства, прочности, силы, великодушия, интеллекта и солнечного света; – белый цвет (серебро) – символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения. | 
